La structure de caisse de C1 assure une excellente protection des occupants :
- les blocs avant et arrière sont composés de brancards à déformation programmée ;
- le soubassement et les montants de pare-brise ont été étudiés pour absorber et dissiper l’énergie vers l’arrière du véhicule ;
- des barres de renfort dans les portes protègent les passagers lors de chocs latéraux.

C1 peut disposer de jusqu'à quatre airbags (selon les niveaux de finition) pour une protection optimale des passagers :
- deux airbags frontaux (l’airbag passager est désactivable afin d’installer un siège bébé à l’avant) ;
- deux airbags latéraux qui protègent le thorax et l’abdomen des passagers.

C1 est équipée d’un dispositif de freinage particulièrement complet :
- deux disques ventilés à l’avant ;
- un ABS (Anti Blocking System) qui régule électroniquement la pression de freinage pour éviter le blocage des roues ;
- un Répartiteur Electronique de Freinage (REF) qui équilibre la pression de freinage entre les roues ;
- un CSC (contrôle de stabilité en courbe) qui stabilise la trajectoire lors du freinage en courbe.

L’ESP (Electronic Stability System) garantit un contrôle optimal du véhicule dans les situations les plus délicates.
Il stabilise la trajectoire en cas de perte d’adhérence dans les virages en agissant sur la répartition du freinage et le régime du moteur.

La banquette arrière (avec dossier 50/50) bénéficie de fixations Isofix à trois points d'ancrage afin d’installer des sièges enfant en toute sécurité.